Granty:
Vančura, M., Kubeš, J., Kraft, S., Karvánková, P., Blažek, M., 2010-2012.
Geografické aspekty organizace funkčního městského regionu Českých Budějovic. Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích,
Pedagogická fakulta, katedra geografie, grant GAJU, reg. č. 072/2010/S.
Papáček, M., …, Kubeš, J., …, 1998-2004. Biodiverzita a společenstva vod. Jihočeská univerzita
v Českých Budějovicích, Pedagogická fakulta, katedra biologie, katedra geografie, …, grant CEZ MŠMT, reg. č. J06/98/124100001.
Vágner, J., …, Kubeš, J., …, 2001-2003. Druhé bydlení v České republice a vztah k jiným formám cestovního
ruchu. Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta, katedra sociální geografie a regionálního rozvoje, Jihočeská
univerzita v Českých Budějovicích, Pedagogická fakulta, katedra geografie, …, grant GAČR, reg. č. 403/01/0726.
Kubeš, J., Perlín, R., 1997-1999. Trvale udržitelný rozvoj venkova. Stabilita venkovského osídlení a prostorové
plánování - významné podmínky trvale udržitelného rozvoje venkova. Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Pedagogická
fakulta, katedra geografie, Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta, katedra sociální geografie a regionálního rozvoje,
grant GAČR, reg. č. 205/97/0081.
Boháč, J., Kubeš, J., Fuchs, R., Sedláček, F., 1992-1994. Venkovská sídla jako biocentra v zemědělské krajině,
Ústav krajinné ekologie ČSAV v Českých Budějovicích, grant Grantové agentury Akademie věd ČR, reg. č. A64904.
Perlín, R., …, Kubeš, J.,…, 1992-1993. Program obnovy venkova, Výzkumný ústav výstavby a architektury Praha
pro Ministerstvo hospodářství ČR.
Zemek, F., Škoda, S., Žaloudík, J., Kubeš, J., 1991-1993. Model ekologického informačního systému s využitím
DPZ. Ústav krajinné ekologie ČSAV v Českých Budějovicích, grant GAČR, reg. č. 64909.
Perlín, R., …, Kubeš, J., 1991. Zásady provozu a rozvoje sídel venkovského typu a programy rozvoje jejich
funkčních složek. Výzkumný ústav výstavby a architektury v Praze pro Ministerstvo hospodářství ČR, reg. č. 400.
Škopek, V., …, Kubeš, J., …, 1986-1990. Různé výzkumné úkoly zabývající se tzv. "geoekologickým a antropoekologickým"
hodnocením krajiny, Ústav krajinné ekologie ČSAV v Českých Budějovicích, výzkumy v rámci Státního plánu závěrečného výzkumu.